Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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TMCO5AQ8N6Q1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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TMCO5AQ8N6Q1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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TMCO5AQ8N6Q1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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TMCO5AQ8N6Q1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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TMCO5AQ8N6Q1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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TMCO5AQ8N6Q1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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TMCO5AQ8N6Q1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TMCO5AQ8N6Q1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TMCO5AQ8N6Q1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMCO5AQ8N6Q1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TMCO5AQ8N6Q1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TMCO5AQ8N6Q1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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