Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
P3H3Q8IVL6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
P3H3Q8IVL6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
P3H3Q8IVL6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
P3H3Q8IVL6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
P3H3Q8IVL6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
P3H3Q8IVL6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
P3H3Q8IVL6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
P3H3Q8IVL6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
P3H3Q8IVL6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H3Q8IVL6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
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