Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms