Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms