Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0Q8

RHOU, Rho-related GTP-binding protein RhoU, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOUQ7L0Q8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOUQ7L0Q8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOUQ7L0Q8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOUQ7L0Q8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOUQ7L0Q8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOUQ7L0Q8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOUQ7L0Q8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOUQ7L0Q8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms