Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms