Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms