Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q6P435 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q6P435 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q6P435 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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