Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3F3CQ6NXT2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms