Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD4Q6IC98 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms