Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD1Q5SYB0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms