Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALFQ53S48 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms