Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms