Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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