Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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