Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECM1Q16610 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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