Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF239Q16600 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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