Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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DDB1Q16531 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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DDB1Q16531 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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DDB1Q16531 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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DDB1Q16531 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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