Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms