Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK4Q16099 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms