Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NEDD8Q15843 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NEDD8Q15843 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NEDD8Q15843 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NEDD8Q15843 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NEDD8Q15843 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NEDD8Q15843 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NEDD8Q15843 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NEDD8Q15843 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NEDD8Q15843 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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