Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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