Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA1Q15788 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
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