Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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UBE3CQ15386 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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UBE3CQ15386 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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UBE3CQ15386 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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UBE3CQ15386 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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UBE3CQ15386 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE3CQ15386 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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