Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms