Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GAPVD1Q14C86 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
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