Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms