Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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CHD4Q14839 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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CHD4Q14839 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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CHD4Q14839 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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CHD4Q14839 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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CHD4Q14839 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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CHD4Q14839 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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CHD4Q14839 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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CHD4Q14839 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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CHD4Q14839 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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CHD4Q14839 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD4Q14839 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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CHD4Q14839 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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