Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms