Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPARCL1Q14515 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms