Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDE7AQ13946 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
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