Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms