Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms