Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms