Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOFQ13790 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOFQ13790 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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