Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTK7Q13308 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTK7Q13308 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms