Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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