Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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