Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD4Q12950 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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