Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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