Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FOXF2Q12947 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FOXF2Q12947 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF2Q12947 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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