Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FOXF1Q12946 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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FOXF1Q12946 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FOXF1Q12946 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FOXF1Q12946 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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