Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A2Q12908 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms