Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROQ12816 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROQ12816 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROQ12816 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
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