Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP160Q12769 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NUP160Q12769 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
NUP160Q12769 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NUP160Q12769 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NUP160Q12769 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP160Q12769 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms