Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms