Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM1Q08AH1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms