Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms