Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms