Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALD1Q05682 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms